Streptococcus parauberis alfa hemolitik, gram pozitif
kokoid bir bakteri olup Streptococcaceae familyasına
aittir. Bu bakteri kültür
balıklarında yoğun üretimden kaynaklı çok önemli bir hastalık olan
streptokokozise neden olmaktadır ve balık çiftliği endüstrisinde önemli bir
ekonomik kayba neden olmaktadır.
Çalışmamızda Eğirdir gölü balıklarından (Sander lucioperca, Carassius
gibelio, Cyprinus carpio) ve
kültür balığı türü olan (Oncorhynchus
mykiss, Walbaum)’dan 37 tane laktik asit bakterisi izole edilmiştir. Laktik
asit bakterilerinin tanımlanması için MRS, TSA ve M17 agardan izole edilen 37
izolatın fenotipik ve morfolojik karakterleri koloni morfolojisi, hücre
morfolojisi, hareketlilik, gram boyama, katalaz ve oksidaz üretimiyle yapılmıştır.
Diğer biyokimyasal özellikler de Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology’e
göre yapılmıştır. İzole edilen bakterilerinden 25 tanesi S. parauberis, 2 tanesi Vagococcus
sp., 2 tanesi Lactococcus garvieae ve
5 tanesi de Lactococcus lactis olarak
biyokimyasal yöntemler ve 16Sr RNA gen sekansıyla tanımlanmıştır fakat 3 tanesi
(F65, F49 ve F50) tanımlanamamıştır. Çalışmamızda S. parauberis’in izolasyon ve identifikasyonu ilk olarak
Türkiye’deki Eğirdir gölü balıklarından ve gökkuşağı alabalığından gerçekleştirildi.
16Sr RNA Tatlısu moleküler tanımlama balık hastalığı yetiştiricilik
Streptococcus
parauberis
is an alpha-hemolytic gram positive coccoid bacterium belonging to the Streptococcaceae
family. This bacterium cause streptococcosis is a major disease in cultured
fish due to the intensification of aquaculture and causes significant economic
losses in fish farm industry. In our study, we isolated a total of 37 lactic
acid bacteria from wild fish (Sander lucioperca, Carassius gibelio,
Cyprinus carpio) of Lake Eğirdir and cultured fish (Oncorhynchus
mykiss, Walbaum) of farm in Turkey. For the isolation of bacteria
phenotypic and biochemical characteristics of the 37 isolates obtained from the
colonies grown on MRS, TSA and M17 agar characterized by determining colony
morphology, cell morphology, motility, gram staining and the production of
cytochrome oxidase and catalase. Further biochemical characteristics were
determined using conventional tests according to Bergey’s Manual of Systematic
Bacteriology. From the isolated lactic acid bacteria 25 of were identified as S.
parauberis, 2 of as Vagococcus sp., 2 of as Lactococcus garvieae
and 5 of as Lactococcus lactis by culture-based, biochemical test and 16Sr
RNA gene sequencing techniques but 3 of them couldn’t (F65, F49 and F50)
identified. In this study, the main
objective of us is to identify S. parauberis with conventional and 16Sr
RNA gene sequencing techniques from wild fish in Lake Eğirdir and in cultured
fish in fish farm of Egirdir-Turkey.
freshwater molecular identification fish disease aquaculture 16Sr RNA
Bölüm | Araştırma Makalesi |
---|---|
Yazarlar | |
Yayımlanma Tarihi | 29 Aralık 2017 |
Yayımlandığı Sayı | Yıl 2017Cilt: 3 Sayı: 3 |